291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2063 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  100 
 
 		 144 aa  297  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  64.14 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  60.31 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  63.78 
 
 		 139 aa  164  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  57.14 
 
 		 169 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  57.14 
 
 		 146 aa  163  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  64 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  56.06 
 
 		 136 aa  159  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  60.94 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  63.78 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  63.78 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  54.41 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  56.59 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  56.25 
 
 		 129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  56 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  53.54 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  64.57 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  60.14 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  62.31 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  62.31 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  53.17 
 
 		 131 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  59.06 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  59.06 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  59.06 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  59.06 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  59.06 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  59.06 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  57.48 
 
 		 174 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  44.53 
 
 		 138 aa  106  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  46.56 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  40.91 
 
 		 133 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  36.72 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  36.09 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  34.59 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  34.59 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  37.98 
 
 		 241 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  38.76 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  39.1 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 		 146 aa  67  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  36.36 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 222 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 253 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  36.56 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2857  rhodanese domain-containing protein  37.72 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.871228  normal  0.0137642 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  36.9 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  43.24 
 
 		 247 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 221 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  33.33 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 222 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 220 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 228 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1401  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.328336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.35 
 
 		 393 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  30.56 
 
 		 480 aa  52  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 218 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  28.7 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  34 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.89 
 
 		 390 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29.35 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 252 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1899  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.36 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  29.9 
 
 		 184 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.51 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  29.75 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.89 
 
 		 399 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.37 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>