58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4215 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  91.35 
 
 		 266 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  59.15 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  57.76 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  43 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  44.83 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  33.96 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  43.18 
 
 		 479 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  35.77 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  37.36 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  37.62 
 
 		 111 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  32.26 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  35.2 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  32.11 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  30.97 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  32.94 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  32.56 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  32.33 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  35.35 
 
 		 166 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  31.58 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  36.9 
 
 		 307 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  34.95 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  39.13 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  32.52 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  37.35 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  37.35 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  40.23 
 
 		 497 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  38.89 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  35.79 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  37.04 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  38.46 
 
 		 341 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  35.14 
 
 		 462 aa  48.9  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  27.73 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  34.44 
 
 		 119 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  31.37 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  33.72 
 
 		 100 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  35.16 
 
 		 109 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  35.16 
 
 		 109 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  35.16 
 
 		 109 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  35.16 
 
 		 109 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  35.16 
 
 		 109 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  31.3 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  29.51 
 
 		 122 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  29.07 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  27.19 
 
 		 197 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  31.62 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  33.66 
 
 		 570 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  27.72 
 
 		 877 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  30.34 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  32.95 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  31.76 
 
 		 463 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  32.43 
 
 		 129 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  28.02 
 
 		 227 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  32.32 
 
 		 405 aa  42.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  29.36 
 
 		 206 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>