More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2470 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2470  ABC transporter related protein  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1595  ABC transporter related  57.14 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1339  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.93 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0926  ABC transporter related  53.74 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4559  ABC transporter related  53.24 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0843  ABC transporter related  52.75 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0700167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0914  ABC transporter, ATPase subunit  52.29 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4707  ABC transporter related  52.36 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.148453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2633  cation ABC transporter, ATP-binding protein  50.92 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.026437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0977  ABC transporter related  53.21 
 
 		 304 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2366  ABC transporter  50.46 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  0.385814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1046  ABC transporter related  53.46 
 
 		 303 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4828  ABC transporter related  49.54 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1174  ABC transporter related  53.46 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3428  ABC transporter related  51.83 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3702  ABC transporter component  49.79 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.944565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3498  ABC transporter related  48.39 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.807491  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5584  ABC transporter related  50.45 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148029  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3129  ABC transporter related  50.93 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1144  ABC transporter related  50.23 
 
 		 256 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5387  ABC transporter related  50.69 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2053  ABC transporter related  49.08 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0621  ABC transporter related  49.77 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172032  normal  0.884508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0676  ABC transporter related  50.23 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0618309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  48.23 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1065  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.87 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3562  ABC transporter-related protein  50.46 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.300624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2782  ABC transporter related  49.32 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433508  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0352  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1121  ABC transporter-related protein  45.41 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0122299  unclonable  0.0000000107473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3390  ABC transporter related  52.61 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164127  normal  0.0284347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1310  ABC transporter related  44.55 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0178  ABC transporter related  46.98 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2229  ABC transporter related  51.15 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  44.5 
 
 		 239 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0106  cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 280 aa  177  9e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3178  ABC transporter related  43.27 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0705  ABC transporter related  44.91 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.937259  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1974  ABC transporter, ATP-binding component  37.28 
 
 		 235 aa  167  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  40.09 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.5 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1532  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 		 238 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0146366  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0951  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  33.33 
 
 		 247 aa  154  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  31.33 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10481  ABC transporter ATP-binding protein  37.23 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.194871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1011  ATPase  37.39 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.204422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1487  ATPase  38.74 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51658  normal  0.183723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  39.37 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5659  ABC transporter-like  37.5 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878914  normal  0.0991539 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  39.23 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  30.9 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  30.9 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18701  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  37.67 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  36.96 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  34.93 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 		 261 aa  144  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0038  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  38.68 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1611  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  38.76 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00104171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0248  ABC transporter related  37.67 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06581  ABC transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.173088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0083  iron/manganese transport system membrane protein SitB  38.76 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921207  hitchhiker  0.000000822462 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  33.79 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3171  iron/manganese transport system inner membrane protein SitB  38.76 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  36.2 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  36.4 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.9 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.24 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.7 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  36.89 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  38.81 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  36.65 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  34.62 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  36.82 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  36.77 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  36.94 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  31.94 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  36.45 
 
 		 278 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  37.22 
 
 		 289 aa  138  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2484  ABC transporter related  33.33 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  39.09 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2564  ABC transporter related  36.24 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.400357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  35.51 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1112  ABC transporter related  37.32 
 
 		 274 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3624  ABC transporter related  33.33 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2132  ABC transporter-related protein  33.19 
 
 		 296 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.350282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0905  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, ATPase subunit SitB  37.67 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  36.65 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>