More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1277 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1277  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 481 aa  1003    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  87.92 
 
 		 485 aa  871    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0485  tetratricopeptide repeat protein  42.71 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0540  tetratricopeptide repeat protein  42.71 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0479  tetratricopeptide repeat protein  42.51 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0477  tetratricopeptide repeat protein  42.23 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.486757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0539  hypothetical protein  41.94 
 
 		 503 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0484  hypothetical protein  41.94 
 
 		 503 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0325737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0478  hypothetical protein  41.13 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0476  putative periplasmic protein  41.53 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  39.62 
 
 		 331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  39.25 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  38.93 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  39.25 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  38.87 
 
 		 331 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  27.01 
 
 		 831 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  28 
 
 		 1402 aa  103  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  28.71 
 
 		 684 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  28.8 
 
 		 489 aa  97.1  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  26.91 
 
 		 961 aa  94.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  27.48 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  26.72 
 
 		 789 aa  95.1  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  26.76 
 
 		 685 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1493 aa  92.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  27.48 
 
 		 490 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  28.35 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  26.39 
 
 		 376 aa  89  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  24.56 
 
 		 342 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.43 
 
 		 341 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.8 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.93 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  34.36 
 
 		 185 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1877 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.86 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 976 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.35 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  26.03 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.73 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  26.67 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  28.43 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  26.67 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  26.67 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1281 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  26.67 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  27.41 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.46 
 
 		 208 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  36.72 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  27.87 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1032 aa  77.8  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0178  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.1 
 
 		 679 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  35.92 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.9 
 
 		 271 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.61 
 
 		 254 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1037 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  25.1 
 
 		 838 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  30.37 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.9 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.42 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  35.2 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35 
 
 		 2413 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.51 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.34 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.91 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  25.76 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  26.88 
 
 		 1200 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.8 
 
 		 1263 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.18 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.31 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  26.56 
 
 		 1200 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  30.68 
 
 		 245 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1002 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 1430 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 1261 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.1 
 
 		 1260 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  44.23 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.95 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  24.4 
 
 		 693 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  26.54 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.17 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  31.13 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  25.17 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  38.14 
 
 		 731 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.29 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  33.56 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 181 aa  69.7  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  36.8 
 
 		 246 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  31.37 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0496  tetratricopeptide repeat family protein  39.13 
 
 		 615 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5130  hypothetical protein  33.14 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0219324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  26.09 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.77 
 
 		 850 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  33.85 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  25.51 
 
 		 1044 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  25.51 
 
 		 1078 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1134 aa  67  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>