More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4841 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  68.75 
 
 		 256 aa  364  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1731  sorbitol dehydrogenase  69.53 
 
 		 256 aa  358  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0095  sorbitol dehydrogenase  69.53 
 
 		 256 aa  358  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0363  sorbitol dehydrogenase  67.84 
 
 		 257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  67.45 
 
 		 258 aa  352  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  67.06 
 
 		 257 aa  349  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4813  sorbitol dehydrogenase  68.11 
 
 		 257 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2354  sorbitol dehydrogenase  66.67 
 
 		 257 aa  346  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  67.84 
 
 		 255 aa  339  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  61.33 
 
 		 256 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  58.62 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  56.98 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  56.98 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  56.98 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  56.98 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  57.36 
 
 		 258 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  57.36 
 
 		 258 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  57.36 
 
 		 258 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  56.98 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  55.77 
 
 		 260 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  55.81 
 
 		 258 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  55.77 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  55.04 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  54.09 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  54.26 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  55.04 
 
 		 258 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  55.04 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  54.65 
 
 		 276 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  54.65 
 
 		 276 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0464  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.02 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  53.12 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  52.51 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  51.37 
 
 		 262 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0269  sorbitol dehydrogenase  51.76 
 
 		 263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1113  sorbitol dehydrogenase  52.12 
 
 		 262 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  38.34 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  39.41 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.64 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  36.47 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  37.55 
 
 		 269 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  35.83 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 263 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  38.52 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.88 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 282 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  36.29 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  34.63 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  38.93 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  34.52 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  37.65 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  35.2 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 247 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.97 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.97 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>