More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3015 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3015  TatD family deoxyribonuclease  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.91144e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  36.11 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  36.11 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  41.8 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.11 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  36.51 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.71 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.51 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.51 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  40.78 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.71 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  37.6 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.11 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  36.11 
 
 		 255 aa  181  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.71 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  43.48 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  41.41 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.04 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  33.73 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  39.69 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  37.69 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  38.22 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  36.47 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  38.52 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32.03 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  32.42 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  41.86 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  33.98 
 
 		 464 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  32.3 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  32.3 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.86 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  35.83 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  37.5 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  36.82 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.56 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  31.5 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0541  hydrolase, TatD family  33.2 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000604201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.17 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  32.94 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  30.71 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  31.75 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02328  putative metallo-dependent hydrolase  33.2 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  30.86 
 
 		 462 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  32.94 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  30 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  31.52 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  31.64 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  32.03 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.35 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  31.94 
 
 		 606 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  33.2 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  32.05 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  33.2 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  35.69 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  31.1 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  32.28 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  30.59 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  30.12 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  31.37 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  30.35 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  31.62 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  30.59 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  32.81 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  30.59 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  31.25 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  31.66 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  32.27 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  32.03 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  38.89 
 
 		 253 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  35.18 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  34.75 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  30.86 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  28.63 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  30.77 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  32.57 
 
 		 462 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  30.86 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.57 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  34.16 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  31.89 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  34.48 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1357  hypothetical protein  31.27 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  35.69 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  32.68 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  30.86 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  30.47 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  30.35 
 
 		 266 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  30.35 
 
 		 274 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  33.07 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  32 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  30.47 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  30.47 
 
 		 283 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  33.73 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  33.86 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  30.89 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  38.49 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  32.55 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  31.68 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>