100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2896 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  100 
 
 		 405 aa  832    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  58.52 
 
 		 405 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  50.35 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  50.16 
 
 		 544 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  49.38 
 
 		 518 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  50 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  48.24 
 
 		 512 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  49.06 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  49.52 
 
 		 521 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  47.2 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  46.91 
 
 		 521 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  46.33 
 
 		 521 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  48.42 
 
 		 522 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  45.02 
 
 		 522 aa  272  9e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  44.52 
 
 		 599 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  45.16 
 
 		 660 aa  263  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  44.26 
 
 		 585 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  42.77 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  43.27 
 
 		 551 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  43.56 
 
 		 514 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  42.54 
 
 		 569 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  41.85 
 
 		 724 aa  232  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  40.73 
 
 		 1117 aa  219  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  41.55 
 
 		 596 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  34.5 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  41.14 
 
 		 821 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  38.54 
 
 		 585 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  30.4 
 
 		 478 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  47.42 
 
 		 522 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  43.04 
 
 		 542 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  31.08 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  29.12 
 
 		 470 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  30.9 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  47.6 
 
 		 690 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  34.94 
 
 		 638 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  37.41 
 
 		 644 aa  169  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  42.06 
 
 		 802 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  27.71 
 
 		 498 aa  167  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  37.23 
 
 		 524 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  40.93 
 
 		 781 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  32.05 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  32.05 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  45.79 
 
 		 649 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  29.1 
 
 		 479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  28.6 
 
 		 500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  31.51 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  44.09 
 
 		 697 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  42.33 
 
 		 700 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  39.11 
 
 		 734 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  39.13 
 
 		 686 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  41.3 
 
 		 522 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  38.55 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  39.11 
 
 		 517 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  36.76 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  25 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  25 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  29.58 
 
 		 740 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  27.65 
 
 		 740 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  27.6 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  24.4 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  28.38 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  27.75 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  24.47 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  26.55 
 
 		 475 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  24.64 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  27.57 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  27.83 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  27.42 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  26.87 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  24.71 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  28.11 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  25.55 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  25.55 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  25.11 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  25.12 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  24.6 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  24.6 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  24.57 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  25.79 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  25.4 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  24.76 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  23.63 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  23.7 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  23.7 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  23.7 
 
 		 390 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  27.06 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  28.36 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  26.29 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  25.74 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  24.16 
 
 		 476 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  29.67 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  26.29 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  24.28 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  23.1 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  25.71 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  25.14 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2515  hypothetical protein  24.73 
 
 		 518 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  23.03 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  23.03 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  25.14 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>