More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2750 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  65.45 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  64.11 
 
 		 267 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  59.36 
 
 		 258 aa  318  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  53.1 
 
 		 258 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  54.66 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  59.76 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  53.14 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  48.44 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  49.18 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  54.42 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  50.2 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  49.79 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  47.37 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  48.13 
 
 		 302 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  50.2 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  48.62 
 
 		 265 aa  240  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  50.82 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  47.83 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  48.61 
 
 		 273 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  48.02 
 
 		 273 aa  224  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  45.75 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  47.2 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  43.72 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  46.28 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.44 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2003  ABC transporter related  48.99 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  40.52 
 
 		 281 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.04 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  45.25 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  46.61 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  46.94 
 
 		 271 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  45.11 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  43.51 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  44.83 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  45.56 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  45.71 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  44.94 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  43.9 
 
 		 273 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  43.9 
 
 		 273 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  45.04 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  42.68 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  44.26 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  43.67 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  47.98 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  41.53 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  42.34 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  44.63 
 
 		 280 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  44.13 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  41.87 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  45.23 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  44.13 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  44.13 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0404  ABC transporter related  43.44 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.027511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  44.13 
 
 		 273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 		 304 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  46.12 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  43.39 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  45.71 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  43.57 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2909  ABC transporter related  42.34 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  42.69 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  43.09 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  43.8 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2285  ABC transporter related  42.34 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  42.91 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  42.97 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  42.34 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  41.83 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  44.21 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  42.28 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.98 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  41.46 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  45.93 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  43.27 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1983  ABC transporter related  41.38 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366377  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0169  ABC transporter related  39.92 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  42.21 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  42.21 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  41.87 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  44.21 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  45.71 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  41.63 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  42.21 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.28 
 
 		 264 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  42.11 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  42.51 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  39.52 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  41.87 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  43.98 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  42.91 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  42.91 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>