223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2483 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  221  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  73.21 
 
 
121 aa  168  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  36.94 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  35.48 
 
 
300 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  32.5 
 
 
302 aa  63.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  38.61 
 
 
303 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  29.66 
 
 
439 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  35.96 
 
 
302 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  29.36 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  36.54 
 
 
310 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  35.71 
 
 
252 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  34.23 
 
 
306 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  36.59 
 
 
306 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  36.59 
 
 
306 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  35.87 
 
 
261 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  35.59 
 
 
305 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  35.59 
 
 
296 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  35.19 
 
 
251 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  35.77 
 
 
306 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  31.86 
 
 
255 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  37.25 
 
 
315 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  41.33 
 
 
307 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  33.64 
 
 
312 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  35.71 
 
 
262 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  32.98 
 
 
261 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  36.47 
 
 
330 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  38.24 
 
 
304 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  37.5 
 
 
270 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  30.4 
 
 
261 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  32.98 
 
 
261 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  38.82 
 
 
313 aa  53.9  0.0000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  29.91 
 
 
259 aa  53.5  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  32.98 
 
 
261 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  39.56 
 
 
251 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  41.46 
 
 
307 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  35.23 
 
 
266 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  35.05 
 
 
246 aa  52.4  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  36.61 
 
 
324 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  32.98 
 
 
293 aa  51.6  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  38.03 
 
 
261 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  33.33 
 
 
304 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
267 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  38.96 
 
 
305 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  34.92 
 
 
270 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  37.63 
 
 
306 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  34.65 
 
 
251 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  34.43 
 
 
268 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  34.07 
 
 
251 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  36.56 
 
 
316 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  31.87 
 
 
242 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  34.94 
 
 
299 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  36.56 
 
 
316 aa  50.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  33.33 
 
 
298 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  37.23 
 
 
305 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  30.61 
 
 
260 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
286 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  39.47 
 
 
266 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
244 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  36.17 
 
 
308 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  35.64 
 
 
318 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  36.67 
 
 
260 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4952  protein of unknown function DUF81  35.16 
 
 
262 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
250 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  34.02 
 
 
278 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2913  protein of unknown function DUF81  36.29 
 
 
272 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  36.08 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02210  hypothetical protein  32.41 
 
 
267 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  26.67 
 
 
261 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1601  Cpp22  31 
 
 
246 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  34 
 
 
268 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 
320 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  33.66 
 
 
268 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  32.65 
 
 
356 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.88 
 
 
2798 aa  48.9  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  31.19 
 
 
291 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  26.67 
 
 
261 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  41.18 
 
 
307 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  34.31 
 
 
301 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  32.67 
 
 
307 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  36.23 
 
 
259 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  36.23 
 
 
259 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  31.82 
 
 
261 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  36.36 
 
 
308 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  28.46 
 
 
123 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  36.14 
 
 
307 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  35.71 
 
 
307 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  32.53 
 
 
277 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  34.48 
 
 
298 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  32.67 
 
 
270 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5037  protein of unknown function DUF81  31.87 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.092296  normal  0.114228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  36.14 
 
 
307 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  33.8 
 
 
253 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  39.74 
 
 
263 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  36.46 
 
 
333 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>