207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2105 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  64.76 
 
 		 230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  66.08 
 
 		 234 aa  315  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  65.64 
 
 		 227 aa  314  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  63.44 
 
 		 230 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  62.11 
 
 		 232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  63.27 
 
 		 227 aa  310  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  61.57 
 
 		 238 aa  310  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  63.88 
 
 		 228 aa  308  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  64.32 
 
 		 232 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  60.79 
 
 		 227 aa  304  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  60.96 
 
 		 231 aa  301  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  60.54 
 
 		 232 aa  292  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  62.28 
 
 		 234 aa  288  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  57.71 
 
 		 240 aa  276  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  56.39 
 
 		 230 aa  269  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  54.82 
 
 		 259 aa  261  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  46.9 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  44.64 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  45.13 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  44.64 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  44.2 
 
 		 232 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  46.02 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  42.98 
 
 		 236 aa  202  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  42.48 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  38.43 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  38.77 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  37.44 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  36.12 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  38.77 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  35.37 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  30.22 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  28.41 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  28 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  30.29 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  27.43 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  31.49 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  29.17 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  26.09 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  27.17 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  26.63 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  31.67 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  28.41 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  28 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  27.42 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  30.59 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  30.77 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  26.14 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  33.12 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  28.25 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5145  predicted protein  29.1 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  32.03 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  26.86 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  32.03 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2251  urease accessory protein UreG  32.88 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  28.25 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  27.6 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  31.54 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  26.14 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  27.59 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  29.12 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  28.24 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  30.6 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  31.15 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  28 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1723  urease accessory protein UreG  29.17 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1198  urease accessory protein UreG  29.12 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  0.215478 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  27.68 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  31.54 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1556  urease accessory protein UreG  26.9 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1684  urease accessory protein UreG  29.8 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  30.2 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  25.57 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  25.14 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  30.6 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1424  urease accessory protein UreG  31.15 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  32.89 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  29.53 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1358  urease accessory protein UreG  28.57 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1137  urease accessory protein UreG  28.57 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  27.72 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  25 
 
 		 288 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64670  urease accessory protein UreG  32.21 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00341231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3881  hydrogenase accessory protein HypB  25.57 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  29.33 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  26.67 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  26.9 
 
 		 277 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0884  urease accessory protein UreG  27.01 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0380  urease accessory protein UreG  30.87 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.235072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1244  urease accessory protein UreG  28.42 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2360  urease accessory protein UreG  28 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.553398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  30 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  26.29 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  25.71 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  32.21 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2317  urease accessory protein UreG  28 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.301422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>