77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2032 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  717    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  52.75 
 
 
346 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  53.04 
 
 
346 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  52.15 
 
 
360 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  52.01 
 
 
355 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  49.7 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  40.37 
 
 
375 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  38.63 
 
 
374 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  38.63 
 
 
374 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  38.63 
 
 
368 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  33.64 
 
 
478 aa  165  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  34.74 
 
 
516 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  34.11 
 
 
474 aa  157  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  33.23 
 
 
547 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  32.88 
 
 
488 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  33.44 
 
 
324 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  30.41 
 
 
374 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  34.04 
 
 
334 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  32.57 
 
 
498 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  34.42 
 
 
513 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  31.34 
 
 
423 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  31.53 
 
 
351 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  32.28 
 
 
511 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  30.85 
 
 
489 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  34.52 
 
 
365 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  29.69 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  32.98 
 
 
341 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  30.03 
 
 
500 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  30.48 
 
 
497 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  30.63 
 
 
483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  31.85 
 
 
487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  32.4 
 
 
496 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  31.54 
 
 
346 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  30.94 
 
 
335 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 
485 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  30.63 
 
 
487 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  31.65 
 
 
420 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  29.38 
 
 
486 aa  123  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  29.49 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  29.38 
 
 
486 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  29.06 
 
 
486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  26.35 
 
 
335 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  28.79 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  30.13 
 
 
396 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  29.49 
 
 
399 aa  114  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
487 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  29.35 
 
 
347 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  30.91 
 
 
484 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  29.34 
 
 
482 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  29.08 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  27.94 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  26 
 
 
391 aa  89.4  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  28.09 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  26.77 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  25.81 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  25.81 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  24.84 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  26.06 
 
 
427 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1585  exopolyphosphatase-like protein  25.61 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  25.54 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  20.5 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  29.71 
 
 
865 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  23.15 
 
 
892 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4437  phosphoesterase domain-containing protein  24.39 
 
 
310 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  24.41 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4348  DHH family phosphoesterase  24.71 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.45 
 
 
854 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  25.83 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4738  DHH subfamily 1 protein  24.14 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4722  DHH subfamily 1 protein  24.14 
 
 
310 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4852  DHH subfamily 1 protein  24.14 
 
 
310 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  20.65 
 
 
315 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4336  DHH family phosphoesterase  24.14 
 
 
310 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4501  DHH subfamily 1 protein  24.14 
 
 
310 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0770  phosphoesterase RecJ domain protein  21.54 
 
 
315 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  24.14 
 
 
356 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4734  DHH subfamily 1 protein  23.17 
 
 
310 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>