More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1325 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1325  small GTP-binding protein  100 
 
 		 571 aa  1110    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.936216 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0483  small GTP-binding protein  67.84 
 
 		 580 aa  716    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.742862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0360  small GTP-binding protein  50.83 
 
 		 568 aa  489  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.700124  normal  0.27234 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0262  small GTP-binding protein  50.82 
 
 		 570 aa  486  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  27.29 
 
 		 587 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  27.17 
 
 		 587 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  28.59 
 
 		 606 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  27.16 
 
 		 636 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  28.22 
 
 		 620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  26.31 
 
 		 626 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  28.87 
 
 		 617 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  26.68 
 
 		 637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  26.39 
 
 		 626 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  25.76 
 
 		 637 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  26.82 
 
 		 626 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  25.84 
 
 		 625 aa  153  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  27.05 
 
 		 621 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  27.42 
 
 		 618 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  26.47 
 
 		 597 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  26.41 
 
 		 618 aa  150  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  25.85 
 
 		 626 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  26.32 
 
 		 631 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  25.49 
 
 		 631 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1938  ferrous iron transport protein B  28.84 
 
 		 647 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.31907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  28.62 
 
 		 610 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  27.26 
 
 		 683 aa  146  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  25.81 
 
 		 626 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  27.53 
 
 		 617 aa  144  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  27.63 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  27.32 
 
 		 632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  27.87 
 
 		 628 aa  140  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  28.2 
 
 		 697 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  27.24 
 
 		 621 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  26.43 
 
 		 647 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  27.66 
 
 		 617 aa  137  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  27.38 
 
 		 621 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  28.61 
 
 		 666 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  27.57 
 
 		 662 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  29.56 
 
 		 662 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  29.56 
 
 		 662 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  27.57 
 
 		 662 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  21.88 
 
 		 665 aa  136  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  27.57 
 
 		 662 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  26.69 
 
 		 621 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  26.88 
 
 		 619 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  26.69 
 
 		 621 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  29.56 
 
 		 662 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  28.95 
 
 		 662 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  28.95 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  28.08 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  28.08 
 
 		 662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  27.45 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  26.69 
 
 		 625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  29.25 
 
 		 662 aa  134  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  26.32 
 
 		 693 aa  134  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  27.15 
 
 		 621 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  27.64 
 
 		 615 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  27.73 
 
 		 648 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  27.39 
 
 		 662 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  25.47 
 
 		 664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  27.08 
 
 		 665 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  26.48 
 
 		 631 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  30.19 
 
 		 848 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.64 
 
 		 571 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0850  ferrous iron transport protein B  29.43 
 
 		 695 aa  125  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  26.04 
 
 		 576 aa  123  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  31.46 
 
 		 743 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  28.06 
 
 		 571 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  25 
 
 		 664 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 		 667 aa  121  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  27.53 
 
 		 665 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  25 
 
 		 664 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  30.42 
 
 		 669 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  26.81 
 
 		 664 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  25.7 
 
 		 576 aa  120  6e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  29.15 
 
 		 684 aa  120  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  30.34 
 
 		 774 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  29.13 
 
 		 676 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  28.65 
 
 		 666 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  31.8 
 
 		 741 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  27.02 
 
 		 708 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  26.96 
 
 		 784 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  29.64 
 
 		 816 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  31.34 
 
 		 741 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  29.3 
 
 		 688 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  30.08 
 
 		 738 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  29.39 
 
 		 774 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  30.36 
 
 		 751 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  27.39 
 
 		 714 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  32.62 
 
 		 786 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  31.09 
 
 		 816 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  30.71 
 
 		 766 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  30.71 
 
 		 766 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0599  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 		 640 aa  113  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0621968  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  31.72 
 
 		 770 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  26.04 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  31.72 
 
 		 770 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  24.23 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  32.95 
 
 		 782 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  32.95 
 
 		 766 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>