206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0292 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  100 
 
 		 421 aa  817    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  74.88 
 
 		 404 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  69.98 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  70.73 
 
 		 420 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  55.45 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  44.81 
 
 		 436 aa  352  5e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  35.86 
 
 		 414 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  35.01 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  38.31 
 
 		 417 aa  206  6e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  34.46 
 
 		 413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  33.57 
 
 		 411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  31.9 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  32.83 
 
 		 413 aa  189  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  32.58 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  34.17 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  35.52 
 
 		 397 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  34.83 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  34.26 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  33.42 
 
 		 384 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  30.19 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.23 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  35.57 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  31.3 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.85 
 
 		 419 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  27.29 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  29.24 
 
 		 429 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  27.84 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  27.47 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  27.72 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  28.42 
 
 		 402 aa  103  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  29.77 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  27.78 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1816  arsenite transport protein  87.93 
 
 		 63 aa  101  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26.16 
 
 		 465 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  30.29 
 
 		 404 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.68 
 
 		 421 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.06 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  30.97 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  28.08 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  28.08 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  29.01 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  27.08 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  26.26 
 
 		 431 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  27.23 
 
 		 423 aa  93.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  26.7 
 
 		 425 aa  93.2  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.89 
 
 		 431 aa  93.2  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  27.53 
 
 		 425 aa  93.2  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  24.27 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.19 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  23.8 
 
 		 422 aa  91.7  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.59 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.72 
 
 		 427 aa  89.7  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.52 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.96 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  26.4 
 
 		 429 aa  87  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  27.14 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  26.3 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  27.37 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  27.39 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  26.87 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  26.77 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  25.97 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  27.49 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  30.18 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  25.27 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  26.36 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.09 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  28.53 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  26.36 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  25.69 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  25 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  28.05 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  24.68 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  24.68 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  28.05 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  28.05 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  26.23 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  23.82 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  25.3 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  24.09 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  29.66 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  25.62 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  27.76 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  27.76 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  27.76 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  23.33 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  26.01 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  23.33 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  28.97 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  24.94 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  27.48 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  27.48 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  25.51 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  27.48 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  25.38 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  23.1 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.59 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  25.06 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  25.83 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  26.05 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>