More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1860 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  100 
 
 		 285 aa  577  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  58.27 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  51.78 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  47.23 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  44.23 
 
 		 256 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  47.88 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  45.04 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  45.22 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  45.65 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  46.09 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  44.78 
 
 		 249 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  45.65 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  46.96 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  43.23 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  43.8 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  47.03 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  46.9 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  44.54 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  43.1 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  41.57 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  47.41 
 
 		 246 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  47.62 
 
 		 246 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  47.41 
 
 		 246 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  43.3 
 
 		 237 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  44.44 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  44.44 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.82 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  43.16 
 
 		 242 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  43.16 
 
 		 242 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  39.74 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  36.91 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.33 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.29 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 		 345 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.81 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.66 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.52 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.11 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.38 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.43 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.62 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.22 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.62 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.76 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.73 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.35 
 
 		 323 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.39 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.06 
 
 		 334 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  31.06 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.91 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.31 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  37.08 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  34.21 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  35.97 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.44 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.28 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  36.59 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.09 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  37.08 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  36.95 
 
 		 373 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.04 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.87 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  32.93 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  35 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  35.77 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  35.89 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  35.89 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  35.34 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  35.34 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.82 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.02 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.82 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  35.34 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.06 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  29.88 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  34.15 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.2 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  35.8 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  36.84 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  34.44 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  33.61 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  36.14 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  34.02 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.47 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6847  ABC transporter related  34.33 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  36.14 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  34.13 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.87 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  36.4 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1202  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.54 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.0328977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  36.4 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>