132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2248 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2248  siroheme synthase  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0893363  normal  0.464998 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0119  siroheme synthase  67.14 
 
 		 283 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1896  siroheme synthase  68.25 
 
 		 217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.105096 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  66.98 
 
 		 212 aa  280  8.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1731  siroheme synthase  35.15 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.381088  normal  0.846654 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1159  siroheme synthase  27.27 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.403167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  28.86 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  27.59 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  30.3 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  27.09 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  26.6 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  28.32 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.76 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.15 
 
 		 462 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  27.78 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  30.05 
 
 		 465 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.98 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  30.05 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  26.92 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.96 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  35.82 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  29.77 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1101  siroheme synthase  24.63 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  25.81 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  27.69 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  28.92 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  25.27 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  25.27 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  29.76 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  24.73 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  25.24 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  30.1 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  25.12 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.15 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  25.66 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  24.73 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  30.08 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.63 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  32.35 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  30.37 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  32 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  24.73 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  26.18 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  30.4 
 
 		 407 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  23.63 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  26.7 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  32.52 
 
 		 778 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.77 
 
 		 480 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1423  precorrin-2 dehydrogenase  26.32 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.747148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  22.61 
 
 		 303 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  27.1 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  25.14 
 
 		 303 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.67 
 
 		 473 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  24.18 
 
 		 303 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  28.72 
 
 		 326 aa  52.4  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1689  precorrin-2 dehydrogenase  25.56 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  25.14 
 
 		 303 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  25.14 
 
 		 303 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  30.15 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  26.88 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  22.79 
 
 		 462 aa  51.2  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  22.64 
 
 		 626 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  26.73 
 
 		 464 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  24.47 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  24.64 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  24.88 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  28.1 
 
 		 464 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  31.74 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  28.57 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  23.13 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  24.28 
 
 		 307 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2129  siroheme synthase  37.17 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.86 
 
 		 462 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  24.63 
 
 		 472 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  25.15 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  31.74 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  24.63 
 
 		 472 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.74 
 
 		 472 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1755  siroheme synthase  38.1 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.73 
 
 		 464 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.75 
 
 		 480 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  22.56 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  25.14 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  27.34 
 
 		 153 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  33.33 
 
 		 490 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2187  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  24.72 
 
 		 303 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00312119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  25.49 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  25.37 
 
 		 474 aa  45.4  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1506  siroheme synthase  24.57 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1943  siroheme synthase-like  25.2 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.73 
 
 		 472 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  24.86 
 
 		 458 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  23.11 
 
 		 473 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  23.11 
 
 		 473 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  24.82 
 
 		 498 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  28.8 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  23.71 
 
 		 457 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  23.5 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  28.29 
 
 		 476 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>