52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1423 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1423  precorrin-2 dehydrogenase  100 
 
 		 220 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.747148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1689  precorrin-2 dehydrogenase  94.71 
 
 		 208 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1196  precorrin-2 dehydrogenase  31.98 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  27.97 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  27.27 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  27.13 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  28.67 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2129  siroheme synthase  23.81 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  28.67 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  27.17 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  28.67 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1896  siroheme synthase  25.93 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.105096 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0119  siroheme synthase  25.69 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.32 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.91 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2142  precorrin-2 dehydrogenase  26.17 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1993  precorrin-2 dehydrogenase  26.17 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  27.27 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  27.27 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  27.27 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  27.27 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  27.27 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  25.12 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1986  precorrin-2 dehydrogenase  25.85 
 
 		 156 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.347019  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  28.81 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  25.17 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  22.82 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3166  precorrin-2 dehydrogenase  23.97 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  24.37 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1966  precorrin-2 dehydrogenase  25.34 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2173  precorrin-2 dehydrogenase  25.34 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  24.83 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  24.16 
 
 		 157 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  25.58 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2148  precorrin-2 dehydrogenase  23.81 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  29.69 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  25 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  22.77 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.71 
 
 		 502 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  29.63 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.38 
 
 		 482 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1704  siroheme synthase  23.24 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1159  siroheme synthase  23.13 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.403167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.05 
 
 		 626 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  26.77 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  26.87 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  24.39 
 
 		 326 aa  42  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  18.92 
 
 		 410 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  21.38 
 
 		 188 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  25 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2697  precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2642  precorrin-2 dehydrogenase  33.33 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>