More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0863 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1864  peptidase S49  66.49 
 
 		 550 aa  729    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.534893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0863  peptidase S49  100 
 
 		 552 aa  1114    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1397  peptidase S49  65.03 
 
 		 550 aa  727    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1261  peptidase S49  63.69 
 
 		 522 aa  621  1e-176  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.21154 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0153  peptidase S49  51.67 
 
 		 612 aa  487  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.908032 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0198  peptidase S49  36.41 
 
 		 307 aa  98.6  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.423953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.8 
 
 		 327 aa  97.4  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.34 
 
 		 326 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.25 
 
 		 366 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  31.16 
 
 		 326 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  30.7 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.52 
 
 		 354 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  32.34 
 
 		 329 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2635  peptidase S49  30.63 
 
 		 328 aa  91.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.194824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  31.84 
 
 		 313 aa  91.3  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  32.18 
 
 		 329 aa  90.9  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  33.5 
 
 		 351 aa  90.1  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  33.04 
 
 		 325 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  28.06 
 
 		 332 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  29.35 
 
 		 552 aa  89  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28 
 
 		 350 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.65 
 
 		 357 aa  88.6  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  35.98 
 
 		 349 aa  88.6  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.16 
 
 		 296 aa  87.8  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  31.86 
 
 		 297 aa  87.8  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.76 
 
 		 342 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.52 
 
 		 351 aa  87  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  31.61 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.64 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.73 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  30.19 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.68 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.42 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  26.32 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.02 
 
 		 590 aa  84.3  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.3 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.71 
 
 		 584 aa  84  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.86 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1962  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.36 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.42 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  33.14 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  32.55 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  32 
 
 		 327 aa  83.2  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.81 
 
 		 274 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.82 
 
 		 323 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1739  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.75 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000870898  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  35.05 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  29.83 
 
 		 616 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  32.11 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  27.86 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.17 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.17 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  28.03 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  27.42 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.58 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  33.15 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.92 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  31.11 
 
 		 618 aa  80.5  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.15 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  33.33 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  32.62 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  32.14 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  28.01 
 
 		 318 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1442  signal peptide peptidase A  30.04 
 
 		 320 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000119274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3163  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.87 
 
 		 335 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.73 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  32.45 
 
 		 315 aa  80.1  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  28.01 
 
 		 318 aa  79.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.29 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  31.09 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  30.3 
 
 		 616 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.66 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.88 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.92 
 
 		 272 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.56 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  32.95 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  28.11 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.69 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  31.72 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  31.58 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  27.4 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  31.05 
 
 		 618 aa  77.4  0.0000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.52 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  30.13 
 
 		 616 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  26.52 
 
 		 341 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.77 
 
 		 587 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  31.94 
 
 		 330 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  30.05 
 
 		 269 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  34.09 
 
 		 286 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.52 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.69 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.69 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.95 
 
 		 326 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.63 
 
 		 625 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  31.75 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.52 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.89 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.15 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  31.75 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  30.41 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>