More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1570 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 317 aa  649    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  70.66 
 
 		 317 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  58.79 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  61.17 
 
 		 319 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  57.96 
 
 		 314 aa  366  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  59.81 
 
 		 315 aa  361  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  56.27 
 
 		 318 aa  351  8.999999999999999e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  48.87 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  45.71 
 
 		 312 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  43.65 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.56 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  41.9 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  40.5 
 
 		 315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  39.47 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.88 
 
 		 323 aa  229  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  39.35 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  42.58 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  39.37 
 
 		 315 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  41.35 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  37.82 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  38.83 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 		 318 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  38.31 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  38.14 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  36.22 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  36.77 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  36.45 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  35.99 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  37.78 
 
 		 311 aa  192  9e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  37.94 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  38.92 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  35.44 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  38.59 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  34.09 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 		 315 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 315 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  35.51 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  35.48 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0547193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  34.91 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  35.39 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  36.1 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  33.66 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  36.69 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  33.76 
 
 		 326 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1953  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1467  methionyl-tRNA formyltransferase  36.86 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0397972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  34.58 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  34.94 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 311 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 		 311 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  35.81 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  34.19 
 
 		 313 aa  175  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  32.9 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  35.78 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  32.9 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  36 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  36 
 
 		 310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  35.26 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  35.28 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0014  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  37.06 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0449  methionyl-tRNA formyltransferase  35.74 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353128  normal  0.364478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  35.23 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  32.48 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  35.88 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  33.12 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  35.23 
 
 		 314 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  32.8 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>