More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01925 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  47.43 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.77 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.69 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  44.32 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  44.25 
 
 		 188 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  44.25 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  44.38 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  43.68 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  43.82 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.05 
 
 		 190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  48.03 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  49.01 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  41.71 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  43.43 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  43.58 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  43.39 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.36 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  43.05 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  32.77 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 224 aa  95.5  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 241 aa  94.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 228 aa  94.7  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 239 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.36 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 240 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 239 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 243 aa  91.3  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 243 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.64 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.88 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  39.1 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 240 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 220 aa  85.1  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  41.72 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.11 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.77 
 
 		 427 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  28.83 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.36 
 
 		 378 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  36.08 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  31.32 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.22 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.62 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  25.5 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  25.89 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 378 aa  71.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  34.62 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  24.28 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  34.62 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.89 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  30.46 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.54 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 240 aa  67.8  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.06 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.72 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>