More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5260 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  100 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  93 
 
 		 257 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  77.82 
 
 		 257 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  75.38 
 
 		 260 aa  390  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  75 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  73.93 
 
 		 256 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  73.93 
 
 		 256 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  73.54 
 
 		 256 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  75.49 
 
 		 256 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  68.6 
 
 		 260 aa  361  6e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  67.31 
 
 		 260 aa  351  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  71.43 
 
 		 256 aa  349  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  70.66 
 
 		 261 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  70.25 
 
 		 261 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  70.25 
 
 		 311 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  66.15 
 
 		 260 aa  345  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  68.6 
 
 		 261 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  68.31 
 
 		 265 aa  337  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  69.35 
 
 		 259 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  69.76 
 
 		 259 aa  331  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  65.98 
 
 		 262 aa  322  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  64.2 
 
 		 264 aa  321  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  64.71 
 
 		 266 aa  318  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  65.69 
 
 		 266 aa  318  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  58.24 
 
 		 284 aa  313  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  57.85 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  65 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  65 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  63.57 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  58.66 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  62.76 
 
 		 259 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  57.98 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  58.75 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  59.49 
 
 		 278 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  58.51 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  54.51 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.51 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  54.26 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  54.26 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  53.88 
 
 		 257 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.56 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  54.25 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  55.43 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  50.62 
 
 		 274 aa  251  9.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  54.85 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  51.39 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  50.19 
 
 		 259 aa  241  6e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  50.2 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  47.48 
 
 		 277 aa  241  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  48.55 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  49.62 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  49.38 
 
 		 288 aa  238  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  50.39 
 
 		 259 aa  238  8e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  48.85 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  48.81 
 
 		 262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  50.2 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  48.41 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  46.82 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 265 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.2 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.2 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.2 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.2 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.2 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  48.81 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  50.8 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.82 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.4 
 
 		 272 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  47.35 
 
 		 271 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  49.79 
 
 		 278 aa  231  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  46.27 
 
 		 270 aa  230  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  46.62 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  46.27 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  48.28 
 
 		 271 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  50 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.27 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  48.28 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  48.28 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  48.28 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  48.85 
 
 		 271 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  46.04 
 
 		 268 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  48.85 
 
 		 271 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.44 
 
 		 270 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  46.41 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  45.52 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  48.74 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  45.52 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  46.54 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  46.3 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  46.07 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  45.69 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  47.31 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.21 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  45.69 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  45.69 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  47.41 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>