232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5174 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  100 
 
 		 391 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  95.64 
 
 		 391 aa  688    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  76.8 
 
 		 392 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  74.42 
 
 		 392 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.56 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.38 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  62.03 
 
 		 391 aa  411  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  62.05 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.04 
 
 		 400 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  60.49 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.81 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.74 
 
 		 393 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.74 
 
 		 420 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  54.97 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.26 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  52.71 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.03 
 
 		 382 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3610  Na+/H+ antiporter NhaA  60.41 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3287  Na+/H+ antiporter NhaA  60.67 
 
 		 413 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.15 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.99 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.17 
 
 		 409 aa  368  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  52.15 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.96 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.41 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.74 
 
 		 391 aa  359  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.94 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.87 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.94 
 
 		 389 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.94 
 
 		 389 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.94 
 
 		 389 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  49.48 
 
 		 391 aa  355  5.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  56.1 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.67 
 
 		 389 aa  352  8e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3487  Na+/H+ antiporter NhaA  59.79 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.16157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  55.32 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4502  Na+/H+ antiporter NhaA  59.07 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.48 
 
 		 389 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.41 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0600  Na+/H+ antiporter NhaA  54.45 
 
 		 424 aa  347  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.95 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.12 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.69 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.12 
 
 		 397 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  54.47 
 
 		 393 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.51 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1928  Na+/H+ antiporter NhaA  59.3 
 
 		 376 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  50.66 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.41 
 
 		 391 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  54.21 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  50.8 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.95 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.3 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.3 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.3 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.3 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.3 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5944  pH-dependent sodium/proton antiporter  58.52 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  51.72 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.87 
 
 		 399 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2430  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.22 
 
 		 393 aa  335  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 398 aa  332  7.000000000000001e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  45.77 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7108  pH-dependent sodium/proton antiporter  57.51 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937929  normal  0.0534187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.83 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  51.83 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.57 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.83 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.83 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.57 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.57 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.14 
 
 		 391 aa  328  7e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.83 
 
 		 388 aa  328  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  51.83 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1838  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.06 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2123  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.33 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.79 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  51.05 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  44.98 
 
 		 455 aa  322  5e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.79 
 
 		 394 aa  322  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.32 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  51.06 
 
 		 390 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0580  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.13 
 
 		 391 aa  319  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0119541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  46.4 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.18 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  50.8 
 
 		 402 aa  316  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  45.79 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2778  pH-dependent sodium/proton antiporter  53.07 
 
 		 398 aa  315  8e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  46.86 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  45.17 
 
 		 382 aa  311  9e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.72 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  45.17 
 
 		 382 aa  311  2e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  46.26 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.96 
 
 		 398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.75 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  45.31 
 
 		 406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  49.05 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2336  Na+/H+ antiporter NhaA  46.75 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000768129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  46.8 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.24 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>