More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4540 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  100 
 
 		 316 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  81.19 
 
 		 307 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  68.58 
 
 		 300 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  67.91 
 
 		 297 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  67.57 
 
 		 300 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  64.14 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  64.63 
 
 		 313 aa  391  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  58.13 
 
 		 300 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  54.64 
 
 		 306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  52.36 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  51.68 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  40.56 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  37.04 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  36.45 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  37.33 
 
 		 287 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  35.67 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  37.32 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  35.62 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  36.57 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  35.49 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  32.96 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  35.25 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  34.89 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  33.44 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  35.42 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  27.8 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  29.04 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  31.53 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  28.86 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  28.91 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  31.99 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  30.41 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  27.46 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  29.83 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  26.62 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  27.11 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  28.42 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.76 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.37 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  26.45 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  24.15 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  21.4 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  26.98 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  21.75 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0973  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.08 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  26.3 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93830  predicted protein  27.32 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.36 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  25.33 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.8 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  25.61 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  25.45 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3858  prolyl aminopeptidase  23.81 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4235  putative hydrolase, alpha/beta fold family  24.36 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4171  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  26.94 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  24.63 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  26.7 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4126  putative hydrolase, alpha/beta fold family  23.81 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4011  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3844  prolyl aminopeptidase  23.81 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  25.44 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  26.7 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4324  alpha/beta fold family hydrolase  23.81 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  33.06 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  28.18 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>