179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3679 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  100 
 
 		 310 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  86.13 
 
 		 310 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.95 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  37.86 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  38.25 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  38.18 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47870  hypothetical protein  46.42 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000948386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4125  hypothetical protein  45.66 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00418319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.82 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.81 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.02 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  35.66 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  34.88 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.02 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  31.72 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  34.5 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  34.5 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  34.5 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  28.62 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  32.56 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  28.67 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  33.11 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.53 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  28.57 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.95 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  33.79 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  30.85 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  32.39 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  32.97 
 
 		 291 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  33.57 
 
 		 291 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  31.82 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  34.6 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.6 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  33.1 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  28 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  34.88 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  33.11 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  30.24 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  32.14 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  29.5 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  34.18 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  28.04 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  27.82 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  32.32 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  31.09 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  32.75 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  27.82 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  23.72 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  31.23 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03770  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  34.68 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.248396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  27.97 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  26.94 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  25.84 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  27.96 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  27.96 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  27.96 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  27.08 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  27.08 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.65 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  30.22 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  31.47 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  27.24 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  28.28 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  27.74 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  26.71 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  28.23 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  28.62 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  28.35 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  30 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  31.99 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  26.07 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  28.12 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  29.11 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  27.55 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  29.29 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  30.56 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  23.68 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  32.6 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  28.77 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.05 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  26.98 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  27.65 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  28.57 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  23.13 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  28.42 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  27.71 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>