101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3147 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3147  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3013  magnesium chelatase subunit ChlD  87.18 
 
 		 195 aa  340  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.586709  normal  0.907591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3096  magnesium chelatase subunit ChlD  70.11 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2271  hypothetical protein  62.56 
 
 		 196 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3505  hypothetical protein  61.54 
 
 		 196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0313202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2771  hypothetical protein  59.9 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26000  putative magnesium chelatase  61.98 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203244  normal  0.298809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2424  hypothetical protein  62.7 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.076736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2222  magnesium chelatase subunit ChlD  58.21 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4584  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  56.99 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  32.8 
 
 		 594 aa  98.6  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1179  Mg-chelatase subunit ChlD-like  32.52 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1659  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  32.52 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.774837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4808  Mg-chelatase subunit ChlD-like  32.82 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1611  Mg-chelatase subunit ChlD  33.16 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.193118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0273  putative magnesium chelatase  33.16 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0735545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1941  protoporphyrin IX magnesium chelatase  33.16 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1957  protoporphyrin IX magnesium chelatase  33.16 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0887  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00821077  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1633  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  31.86 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0312665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1580  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  30.05 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.924484  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2102  hypothetical protein  32.62 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5003  hypothetical protein  32.83 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000123501  hitchhiker  0.0000143194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5744  hypothetical protein  36.09 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  hitchhiker  0.0000337383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1644  hypothetical protein  35.88 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000465532  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1559  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  31.66 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2405  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  32.09 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  30.05 
 
 		 614 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  35.39 
 
 		 657 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  34.46 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1578  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  31.16 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  30.46 
 
 		 699 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.6 
 
 		 653 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.54 
 
 		 673 aa  71.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.78 
 
 		 688 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  32.77 
 
 		 719 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  31.94 
 
 		 705 aa  69.3  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  29.73 
 
 		 660 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.44 
 
 		 616 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  31.58 
 
 		 674 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  27.57 
 
 		 776 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  31.94 
 
 		 637 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  34.07 
 
 		 738 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 		 674 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3150  magnesium chelatase subunit ChlD  31.28 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  27.51 
 
 		 689 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.41 
 
 		 674 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  32.97 
 
 		 730 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  31.09 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.74 
 
 		 788 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  29.03 
 
 		 670 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  28.5 
 
 		 612 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  25.81 
 
 		 650 aa  58.2  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0124  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00784287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  29.6 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  27.46 
 
 		 653 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.29 
 
 		 619 aa  55.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  27.42 
 
 		 617 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  26.09 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 		 690 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.07 
 
 		 619 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.33 
 
 		 618 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  22.83 
 
 		 643 aa  52.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.76 
 
 		 620 aa  52.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.81 
 
 		 622 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.81 
 
 		 622 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.81 
 
 		 622 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  29.67 
 
 		 629 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  24.6 
 
 		 669 aa  51.6  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.68 
 
 		 671 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.39 
 
 		 618 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.09 
 
 		 618 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  23.12 
 
 		 619 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  30.46 
 
 		 638 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  26.73 
 
 		 696 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.95 
 
 		 665 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.83 
 
 		 678 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  29.44 
 
 		 626 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  34.58 
 
 		 605 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.87 
 
 		 610 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.3 
 
 		 636 aa  48.5  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.18 
 
 		 621 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.99 
 
 		 672 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.32 
 
 		 608 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  29.05 
 
 		 664 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.55 
 
 		 668 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  23.77 
 
 		 600 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  28 
 
 		 618 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.84 
 
 		 673 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.84 
 
 		 673 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 		 749 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1421  von Willebrand factor type A  24.32 
 
 		 329 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.301249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  33.33 
 
 		 754 aa  45.1  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.29 
 
 		 677 aa  44.7  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  26.92 
 
 		 800 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0107  magnesium chelatase  22.73 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0353838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4482  von Willebrand factor type A  21.69 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  24.49 
 
 		 265 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  31.54 
 
 		 580 aa  42  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  27.52 
 
 		 725 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>