More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4692 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  100 
 
 
313 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  96.81 
 
 
313 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  79.67 
 
 
312 aa  511  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 
323 aa  241  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 
315 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 
340 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
339 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
339 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 
316 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
312 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
345 aa  177  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
312 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
346 aa  175  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  36.67 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
333 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
291 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
291 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
291 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  31.05 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
309 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
297 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
287 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
302 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
311 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 
284 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 
279 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 
279 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
279 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
279 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 
279 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  26.04 
 
 
279 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
312 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
291 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
276 aa  102  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  29.02 
 
 
295 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
287 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  25.28 
 
 
279 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  25.28 
 
 
279 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
296 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  24.53 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
290 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.6 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
296 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
279 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
295 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
290 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
290 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
290 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
291 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.56 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
259 aa  92.4  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.56 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
301 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
297 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
290 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.59 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
350 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
267 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
361 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
268 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
295 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
311 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
301 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
287 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
285 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
285 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
285 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
363 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.62 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>