More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4332 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4332  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50810  hypothetical protein  94.68 
 
 		 293 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1228  OmpA/MotB  44.9 
 
 		 364 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1149  OmpA/MotB domain-containing protein  50.46 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.825601  normal  0.159569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4287  OmpA/MotB domain-containing protein  50.46 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1164  OmpA/MotB domain-containing protein  49.78 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1128  OmpA/MotB domain protein  49.78 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4117  ompA family protein  38.74 
 
 		 381 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3854  OmpA/MotB  38.74 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0341238  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1435  OmpA/MotB domain-containing protein  53.29 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.83553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19490  outer membrane protein, OmpA/MotB family  49.38 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  34.56 
 
 		 220 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  34.36 
 
 		 219 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  36.03 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  36.76 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.59 
 
 		 215 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  36.76 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  36.76 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  34.36 
 
 		 219 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  36.76 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  36.76 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  36.03 
 
 		 219 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 231 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 222 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 220 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  38.81 
 
 		 237 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  38.81 
 
 		 237 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  38.69 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.96 
 
 		 218 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  37.31 
 
 		 229 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  37.31 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.52 
 
 		 217 aa  86.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  37.14 
 
 		 235 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  36.03 
 
 		 241 aa  85.5  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  36.03 
 
 		 241 aa  85.5  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  38.35 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  32.88 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  36.76 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  32.88 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  35.77 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  38.97 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.33 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  35.97 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  35.29 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  37.7 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  36.03 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  32.37 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  35.21 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  34.56 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  42.42 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0023  OmpA  54.29 
 
 		 591 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  33.81 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  34.46 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  32.61 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.7 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  37.7 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  37.7 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  33.81 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  36.8 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  48.31 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  34.03 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  38.52 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 		 623 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  38.52 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  38.52 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  38.52 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  38.52 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  38.52 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  33.81 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  32.37 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.69 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  34.56 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>