More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_19490  outer membrane protein, OmpA/MotB family  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1435  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.83553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4287  OmpA/MotB domain-containing protein  54.55 
 
 		 325 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1228  OmpA/MotB  51.81 
 
 		 364 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4117  ompA family protein  51.2 
 
 		 381 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1164  OmpA/MotB domain-containing protein  53.33 
 
 		 325 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1128  OmpA/MotB domain protein  53.33 
 
 		 344 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1149  OmpA/MotB domain-containing protein  51.48 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.825601  normal  0.159569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3854  OmpA/MotB  50.31 
 
 		 386 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0341238  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4332  hypothetical protein  49.38 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50810  hypothetical protein  49.38 
 
 		 293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  35.82 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  35.82 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  35.07 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  34.33 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  32.86 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  37.31 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  34.33 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  37.1 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.1 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  33.33 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  32.84 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  30.3 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  32.84 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  36.76 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  30.3 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  33.1 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  34.81 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.75 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  34.81 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  33.09 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  29.73 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.29 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  37.82 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  34.07 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.07 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  32.61 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  30.82 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  33.09 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  27.22 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  34.81 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  31.43 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  26.76 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 514 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  31.65 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  29.41 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0023  OmpA  37.61 
 
 		 591 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  32.59 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  31.43 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  32.59 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  33.09 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  32.59 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  31.34 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  32.37 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.16 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  36.97 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  31.69 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  35 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  31.62 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  30.77 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  36.92 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  36.13 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  33.6 
 
 		 533 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  36.13 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  36.13 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  36.13 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  36.13 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  31.47 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>