More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4117 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4117  ompA family protein  100 
 
 		 381 aa  751    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3854  OmpA/MotB  92.63 
 
 		 386 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0341238  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1228  OmpA/MotB  63.01 
 
 		 364 aa  371  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4287  OmpA/MotB domain-containing protein  51.69 
 
 		 325 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1149  OmpA/MotB domain-containing protein  52.85 
 
 		 327 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.825601  normal  0.159569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1164  OmpA/MotB domain-containing protein  50.6 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1128  OmpA/MotB domain protein  51.68 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1435  OmpA/MotB domain-containing protein  61.36 
 
 		 217 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.83553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4332  hypothetical protein  40 
 
 		 293 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19490  outer membrane protein, OmpA/MotB family  51.2 
 
 		 215 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50810  hypothetical protein  38.64 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  37.14 
 
 		 222 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 		 220 aa  87  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  34.06 
 
 		 237 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  34.06 
 
 		 237 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  34.04 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  32.86 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  36.81 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  35 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  32.61 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  32.61 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  31.88 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 		 221 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  33.57 
 
 		 221 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  31.88 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  32.88 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  32.39 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  32.35 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  31.13 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  32.86 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  40.86 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  41.94 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 209 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  32.86 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  31.91 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  31.43 
 
 		 225 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  31.91 
 
 		 218 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  34.27 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  34.75 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  35.21 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  34.27 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  37.72 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.8 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  32.14 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  30.07 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  32.62 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  31.43 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.86 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  47.95 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  30.71 
 
 		 219 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  30.71 
 
 		 219 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  30.71 
 
 		 219 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  31.69 
 
 		 224 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 230 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  34.78 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  34.78 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.78 
 
 		 229 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.96 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  34.78 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 230 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 230 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  35.87 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 230 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  32.28 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  40.91 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0023  OmpA  42.5 
 
 		 591 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  30.43 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  35.85 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  35.85 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  31.69 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>