More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4287 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4287  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1164  OmpA/MotB domain-containing protein  93.85 
 
 		 325 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1128  OmpA/MotB domain protein  97.33 
 
 		 344 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1149  OmpA/MotB domain-containing protein  88.39 
 
 		 327 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.825601  normal  0.159569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1228  OmpA/MotB  58.15 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3854  OmpA/MotB  52.06 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0341238  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4117  ompA family protein  51.11 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1435  OmpA/MotB domain-containing protein  65.24 
 
 		 217 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.83553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4332  hypothetical protein  50.68 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50810  hypothetical protein  41.4 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19490  outer membrane protein, OmpA/MotB family  54.55 
 
 		 215 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  40 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  37.59 
 
 		 227 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  38.41 
 
 		 248 aa  93.2  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 223 aa  89.4  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 241 aa  87  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  34.29 
 
 		 241 aa  87  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.62 
 
 		 218 aa  86.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  35.71 
 
 		 241 aa  86.3  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  34.16 
 
 		 228 aa  86.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  35.71 
 
 		 222 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  27.78 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  34.78 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  34.27 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  32.86 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  32.62 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  31.16 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  35.21 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  38.93 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  33.57 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  30.43 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  30.43 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  44.71 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  32.39 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  38.66 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  31.16 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  31.88 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  33.8 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  44.58 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  33.1 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  31.47 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  35.95 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  33.1 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  33.1 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  31.17 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  31.47 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  32.14 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  33.1 
 
 		 230 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  33.8 
 
 		 230 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  35.83 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  36.09 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.34 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  33.1 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  32.87 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  32.62 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  33.1 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  34.59 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.04 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  30.71 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  36.52 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37.74 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.76 
 
 		 422 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  31.69 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 		 623 aa  72.8  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  44.58 
 
 		 542 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>