More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3070 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  100 
 
 		 402 aa  767    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  68.97 
 
 		 407 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  65.52 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  63.57 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  64.71 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  67.91 
 
 		 376 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  61.7 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  60.9 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  59.64 
 
 		 410 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  58.85 
 
 		 410 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  61.93 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  62.19 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  60.27 
 
 		 408 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  60.26 
 
 		 409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  60.48 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  60.48 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  60.93 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  54.97 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  55.42 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  52.74 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  52.24 
 
 		 403 aa  386  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  59.13 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  52.53 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  51.62 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  52.24 
 
 		 402 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 400 aa  298  9e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 396 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  46.58 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 401 aa  289  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 399 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 394 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 400 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  45.26 
 
 		 376 aa  268  8.999999999999999e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 398 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 398 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 413 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  38.25 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  40.16 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  40.16 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  39.9 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  39.9 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  39.9 
 
 		 451 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  39.9 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  38.15 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 412 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  35.75 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  34.52 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  34.93 
 
 		 410 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 398 aa  153  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 397 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 735 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  30.3 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 390 aa  131  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.43 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  29.17 
 
 		 419 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 393 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  28.25 
 
 		 395 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  29.6 
 
 		 405 aa  126  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  27.69 
 
 		 404 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0150  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0159  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>