More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4624 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  98.33 
 
 		 301 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  94.65 
 
 		 301 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  87.29 
 
 		 301 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  71.91 
 
 		 300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1697  putative epoxide hydrolase  64.89 
 
 		 298 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19710  alpha/beta family hydrolase  64.54 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3280  alpha/beta hydrolase fold  58.14 
 
 		 302 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3624  alpha/beta hydrolase fold  43.94 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3365  alpha/beta hydrolase fold  43.2 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11863  hydrolase  37.9 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13197  epoxide hydrolase mesT  28.17 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 290 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01213  probable epoxide hydrolase  46.75 
 
 		 78 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.78 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  27.4 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.87 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.87 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  27.08 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  38.84 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  43.14 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  38.52 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  39 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  32.26 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  41 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  36.97 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  42.11 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  36.3 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  42.31 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  28.47 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  37.41 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.74 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.74 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.6 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  39.45 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  39.45 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.54 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  35.19 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.64 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  35.19 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  25.61 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  28.46 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>