More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_72245 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_10195  valyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_8G04800)  54.63 
 
 		 1033 aa  1163    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04124  valyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 951 aa  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3739  valyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 951 aa  690    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 880 aa  636    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 887 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0977  valyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 948 aa  735    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 909 aa  650    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0741  valyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 955 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 921 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2236  valyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 968 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0129  valyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 904 aa  691    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525564  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0738  valyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 973 aa  707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1035  valyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 972 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.570949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 943 aa  739    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 958 aa  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1268  valyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 948 aa  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1015  valyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 948 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 886 aa  683    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 865 aa  676    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0927  valyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 955 aa  697    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 921 aa  704    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 921 aa  704    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01880  valine-tRNA ligase, putative  51.98 
 
 		 1109 aa  1115    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.332908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 948 aa  724    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 984 aa  681    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 943 aa  682    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0923  valyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 959 aa  711    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0863  valyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 955 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 912 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1669  valyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 955 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1279  valyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 950 aa  720    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1846  valyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 955 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 929 aa  725    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 948 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0393  valyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 952 aa  672    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 885 aa  732    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4585  valyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 955 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 1006 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0959  valyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 950 aa  679    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42662  predicted protein  39.33 
 
 		 924 aa  652    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 887 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 883 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 924 aa  723    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2178  valyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 976 aa  679    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 917 aa  698    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0422  valyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 955 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 909 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 926 aa  711    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 879 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 880 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2633  valyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 955 aa  703    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2390  valyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 1052 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1691  valyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 955 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2742  valyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 958 aa  691    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.829752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2376  valyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 990 aa  658    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 922 aa  731    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33832  predicted protein  52.14 
 
 		 1056 aa  1007    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 943 aa  697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3721  valyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 973 aa  700    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0971795  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1335  valyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 959 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 968 aa  701    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3112  valyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 958 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 947 aa  737    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1137  putative valyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 941 aa  680    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.835272  normal  0.0253174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 984 aa  681    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2630  valyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 955 aa  703    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00324916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0285  valyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 957 aa  681    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.147472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 929 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4005  valyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 927 aa  726    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.311642 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2085  valyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 953 aa  706    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000735472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2896  valyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 976 aa  699    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.588712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0959  valyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 955 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 908 aa  638    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 908 aa  638    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 921 aa  731    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1716  valyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 963 aa  687    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.894816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 880 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 880 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 948 aa  674    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 911 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 958 aa  703    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 958 aa  708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 917 aa  693    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 968 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 		 883 aa  637    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 893 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1321  valyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 955 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 950 aa  719    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 866 aa  671    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72245  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1051 aa  2176    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3650  valyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 951 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.227036 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1460  valyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 955 aa  697    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 884 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1441  valyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 955 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 892 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 929 aa  723    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 958 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3169  valyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 979 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1992  valyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 963 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 886 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>