286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32786 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_32786  predicted protein  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  0.784272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3350  CinA domain-containing protein  38.06 
 
 		 160 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3619  CinA-like  32.56 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.45601  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7139  competence/damage-inducible protein cinA  32.95 
 
 		 160 aa  85.1  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.876288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1678  CinA-like  32.95 
 
 		 163 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1740  competence/damage-inducible protein cinA  32.12 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386919  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  33.14 
 
 		 421 aa  81.3  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1897  CinA domain protein  32.53 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2030  CinA domain protein  34.18 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1417  CinA domain-containing protein  33.12 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  31.28 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.31 
 
 		 433 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  30.46 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  28.81 
 
 		 417 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  33.8 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  29.22 
 
 		 416 aa  71.2  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  30.41 
 
 		 432 aa  69.3  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  30.41 
 
 		 411 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  28.1 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  30.43 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  26.17 
 
 		 419 aa  65.1  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  32.38 
 
 		 416 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  28.49 
 
 		 416 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  30.56 
 
 		 433 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  28.49 
 
 		 416 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.29 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  32.04 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  26.51 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  32.62 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  27.03 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4900  competence/damage-inducible protein CinA  30.71 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  31.58 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  34.06 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  26.71 
 
 		 417 aa  62  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  30.71 
 
 		 408 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  30.82 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  31.91 
 
 		 427 aa  62.4  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  32.84 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  37.11 
 
 		 418 aa  62  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  30.93 
 
 		 400 aa  61.2  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  30.63 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  29.37 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  24.71 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.32 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  26.09 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  28.26 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  29.08 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  30.53 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  27.74 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  27.98 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  34.62 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  32 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  27.65 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  29.07 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  27.27 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  36.96 
 
 		 425 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  30.1 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  29.52 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  31.74 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  33.75 
 
 		 400 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  36.63 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  27.67 
 
 		 429 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  30.99 
 
 		 410 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  29.66 
 
 		 408 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  30.3 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  29.41 
 
 		 408 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  35 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  26.95 
 
 		 423 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  28.15 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  31.82 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  25.97 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  29.85 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  31.25 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  31.48 
 
 		 417 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  28.38 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  28.06 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38570  CinA-related protein  29.63 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0089  competence/damage-inducible protein CinA C- domain  24.84 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0856  competence/damage-inducible protein CinA  35.48 
 
 		 399 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  29.33 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  26.29 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  29.85 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.52 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  28.85 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  26.99 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  28.85 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  29.09 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  32.61 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  32.61 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  32.61 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  34.65 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  27.54 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  25.44 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  27.56 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  30 
 
 		 414 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  25.47 
 
 		 424 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  24.68 
 
 		 415 aa  54.7  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  24.84 
 
 		 415 aa  54.3  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  26.47 
 
 		 423 aa  54.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>