More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43384 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43384  predicted protein  100 
 
 
164 aa  333  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  35.56 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  34.44 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  34.44 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  31.68 
 
 
105 aa  67  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  26.73 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  29.7 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  31.03 
 
 
88 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  30.93 
 
 
105 aa  60.5  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  25.51 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  26.17 
 
 
127 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  31.17 
 
 
98 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  27.62 
 
 
117 aa  58.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  34.31 
 
 
131 aa  57.8  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  29.89 
 
 
102 aa  57.8  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  30 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  33.77 
 
 
89 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  26.74 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  32.28 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  23.71 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  32.28 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  31.33 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  36.59 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1721  thioredoxin domain protein  28.57 
 
 
100 aa  55.1  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  36.59 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  30.59 
 
 
98 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  35.44 
 
 
106 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  27 
 
 
98 aa  54.7  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  31.58 
 
 
90 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  35.37 
 
 
108 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  27.91 
 
 
146 aa  53.9  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  25.96 
 
 
107 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  36.59 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  27.08 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  31.71 
 
 
106 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  36.59 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  27.91 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5974  thioredoxin domain protein  31.08 
 
 
102 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.897668  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  36.59 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  36.59 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  36.59 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  36.59 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  33.77 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  29.89 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  29.76 
 
 
104 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  32.39 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  28.57 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  28.16 
 
 
105 aa  53.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  28.92 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  29.89 
 
 
110 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  29.87 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  29.87 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  27.06 
 
 
107 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5108  Thioredoxin domain protein  25 
 
 
110 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  27.37 
 
 
272 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  32.39 
 
 
106 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  30.23 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  35.37 
 
 
108 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  31.91 
 
 
102 aa  51.6  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  26.25 
 
 
268 aa  51.6  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  31.71 
 
 
106 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  29.07 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  29.07 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  27.45 
 
 
104 aa  51.2  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  30 
 
 
106 aa  51.2  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  27.91 
 
 
141 aa  51.2  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  34.15 
 
 
108 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  29.89 
 
 
109 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  34.15 
 
 
108 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  27.45 
 
 
104 aa  51.2  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  34.15 
 
 
108 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  34.25 
 
 
108 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  27.45 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  29.58 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  26.19 
 
 
142 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  31.82 
 
 
148 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  32.53 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  27.06 
 
 
107 aa  50.8  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  27.06 
 
 
107 aa  50.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  29.21 
 
 
118 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  27.91 
 
 
145 aa  50.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  31.17 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  29.21 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  37.33 
 
 
165 aa  50.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  29.55 
 
 
105 aa  50.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  25.64 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  30.38 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  26.74 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  25.58 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.33 
 
 
102 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  30.12 
 
 
108 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  28.21 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>