160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43106 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43106  predicted protein  100 
 
 		 520 aa  1083    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14990  predicted protein  37.33 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42712  predicted protein  29.42 
 
 		 513 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.732004  normal  0.929724 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87395  predicted protein  25.38 
 
 		 534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  31.82 
 
 		 106 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  33.58 
 
 		 368 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4129  predicted protein  28.19 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07436  protein disulfide isomerase A (Eurofung)  28.91 
 
 		 513 aa  67  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02410  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.142137  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01500  ER to Golgi transport-related protein, putative  23.53 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38141  predicted protein  23.08 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01370  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88514  predicted protein  24.6 
 
 		 555 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43223  predicted protein  31.36 
 
 		 595 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05970  disulfide isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10590)  28.1 
 
 		 731 aa  61.6  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.371345 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00620  disulfide-isomerase precursor, putative  24.09 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42566  predicted protein  28.24 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000000723214  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9509  predicted protein  23.12 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  28.3 
 
 		 110 aa  56.6  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05350  protein disulfide isomerase, putative  21.37 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  30.65 
 
 		 120 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9171  predicted protein  28.7 
 
 		 93 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47306  predicted protein  26.36 
 
 		 193 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719708  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  31 
 
 		 119 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  32.04 
 
 		 119 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  22.54 
 
 		 455 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50192  predicted protein  30.71 
 
 		 357 aa  54.3  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000211726 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17166  predicted protein  23.61 
 
 		 500 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67636  predicted protein  28.57 
 
 		 769 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.969008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  27.03 
 
 		 271 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04350  ER to Golgi transport-related protein, putative  25.28 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380351  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  33.73 
 
 		 209 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  25.2 
 
 		 238 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  30.1 
 
 		 126 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  29.41 
 
 		 106 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  30.4 
 
 		 119 aa  50.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85013  predicted protein  22.89 
 
 		 407 aa  50.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.5193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2484  predicted protein  27.01 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.632802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.18 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  27.68 
 
 		 277 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  26.85 
 
 		 290 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  29.03 
 
 		 289 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32213  predicted protein  22.3 
 
 		 310 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0281124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  29.03 
 
 		 290 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.18 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.03 
 
 		 289 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.18 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  31.18 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  30.61 
 
 		 104 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  30.84 
 
 		 109 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  26.42 
 
 		 112 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  30.34 
 
 		 147 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  26.92 
 
 		 120 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  28 
 
 		 123 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  28.44 
 
 		 289 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11781  predicted protein  25.42 
 
 		 106 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  29.79 
 
 		 107 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  29.41 
 
 		 122 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  26.13 
 
 		 268 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  27.37 
 
 		 290 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  25.95 
 
 		 145 aa  47.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  26.32 
 
 		 126 aa  47.4  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  31.87 
 
 		 98 aa  47  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  27.62 
 
 		 106 aa  47  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02738  COPII-coated vesicle membrane protein Erv46, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05120)  21.57 
 
 		 437 aa  47  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.593307  normal  0.26938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  31.48 
 
 		 110 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  27.83 
 
 		 139 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  27.83 
 
 		 139 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  26.21 
 
 		 112 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  36.17 
 
 		 123 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  25.19 
 
 		 145 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  28.72 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5385  predicted protein  25.3 
 
 		 184 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.117735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  27.83 
 
 		 139 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  28.04 
 
 		 107 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  30.21 
 
 		 107 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  29.69 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  27.83 
 
 		 139 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  27.83 
 
 		 139 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  26.13 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  26.13 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  28.42 
 
 		 290 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  27.18 
 
 		 107 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  26.32 
 
 		 113 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  31.58 
 
 		 109 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  29.55 
 
 		 145 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  31.46 
 
 		 106 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  31.43 
 
 		 229 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  26.97 
 
 		 109 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  30.95 
 
 		 125 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  30.63 
 
 		 109 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  26.13 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  28.57 
 
 		 106 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  31.58 
 
 		 108 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  26.13 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  26.13 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  31.58 
 
 		 108 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  31.58 
 
 		 108 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  26.13 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  26.13 
 
 		 139 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>