More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_36570 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_36570  predicted protein  100 
 
 		 472 aa  965    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  29.69 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  30.7 
 
 		 434 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.82 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  28.3 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.97 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  28.3 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  25.6 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.25 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.76 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  26.67 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  24.26 
 
 		 2457 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  26.79 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  26.23 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  27.94 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  31.43 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.43 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.43 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  25.9 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  23.2 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.68 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.22 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  26.48 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  26.26 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  26.62 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  28.99 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  24.42 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.16 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  25.45 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  32.21 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  28.28 
 
 		 740 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  24.16 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.8 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.5 
 
 		 487 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.09 
 
 		 422 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25.09 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  25.09 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25.09 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  28.77 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  27.17 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.47 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  24.73 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  26.07 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  31.82 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.09 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  23.05 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  23.49 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  25.09 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.35 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.38 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  25.43 
 
 		 848 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.35 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.35 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  24.24 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.81 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.52 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  25.09 
 
 		 713 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  24.17 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  24.53 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.89 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  25.16 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3215  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.55 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.5 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  28.5 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.38 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  24.17 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  25.78 
 
 		 370 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  24.05 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  26.85 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.4 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  24.36 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  24.73 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  26.18 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.14 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  24.03 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.85 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  23.87 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.38 
 
 		 385 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.17 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.05 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  24.36 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  24.36 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  26.03 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  24.36 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  24.36 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  23.56 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  23.56 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  23.56 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  22.95 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  32.89 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  24.02 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  25.21 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.52 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  22.99 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  28.4 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  24 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3047  beta-lactamase  28.9 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  23.64 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30360  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.21 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  28.57 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>