65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12431 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12431  predicted protein  100 
 
 		 801 aa  1680    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  27.63 
 
 		 1821 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  24.28 
 
 		 1783 aa  121  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  24.81 
 
 		 1522 aa  114  6e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0392  phospholipase D/transphosphatidylase  24.39 
 
 		 780 aa  114  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  23.64 
 
 		 818 aa  96.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06712  Phospholipase D [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874F2]  22.08 
 
 		 833 aa  78.2  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355255  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  20.7 
 
 		 759 aa  77.4  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  22.55 
 
 		 533 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18970  phospholipase D  28.69 
 
 		 1103 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000786782  normal  0.317995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  23.76 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.25 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.32 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  23.06 
 
 		 775 aa  69.7  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  22.48 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  22.41 
 
 		 714 aa  67.8  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  23.73 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  25.34 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  22.59 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  26.61 
 
 		 714 aa  64.3  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  26.6 
 
 		 512 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  22 
 
 		 525 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  24.77 
 
 		 730 aa  60.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.11 
 
 		 507 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  25.79 
 
 		 738 aa  60.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.92 
 
 		 516 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  28.22 
 
 		 510 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.92 
 
 		 516 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.4 
 
 		 521 aa  60.1  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  28.37 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0398  phospholipase D/transphosphatidylase  74.29 
 
 		 270 aa  57.4  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.24 
 
 		 514 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  25.08 
 
 		 717 aa  56.2  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  22.13 
 
 		 803 aa  54.3  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.42 
 
 		 474 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49389  predicted protein  27.16 
 
 		 2792 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.86 
 
 		 632 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  24.44 
 
 		 724 aa  52.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  24.5 
 
 		 684 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  22.77 
 
 		 510 aa  52  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  25.7 
 
 		 478 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  23.68 
 
 		 735 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07334  phospholipase D (PLD), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16520)  21.48 
 
 		 1219 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  22.04 
 
 		 497 aa  49.7  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  55.1 
 
 		 745 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.15 
 
 		 502 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03120  transmembrane protein, putative  26.42 
 
 		 1545 aa  48.5  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.147614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2998  phospholipase D/transphosphatidylase  62.86 
 
 		 681 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319786  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.21 
 
 		 504 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  60 
 
 		 676 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  21.7 
 
 		 504 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  22.4 
 
 		 572 aa  46.6  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  60 
 
 		 655 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09149  membrane bound C2 domain protein (vp115), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01840)  26.39 
 
 		 1506 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0327792  normal  0.0431672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  23.5 
 
 		 518 aa  46.2  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.33 
 
 		 544 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  23.73 
 
 		 498 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  74.07 
 
 		 684 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  21.17 
 
 		 512 aa  45.4  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.53 
 
 		 691 aa  45.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  23.73 
 
 		 483 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.78 
 
 		 465 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  23.94 
 
 		 701 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  26.56 
 
 		 483 aa  44.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  57.14 
 
 		 668 aa  44.3  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>