52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3770 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  100 
 
 		 595 aa  1170    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  68.97 
 
 		 606 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  30.45 
 
 		 514 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  57.04 
 
 		 815 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  56.08 
 
 		 269 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  51.33 
 
 		 808 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 		 693 aa  115  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  44.78 
 
 		 643 aa  115  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.19 
 
 		 638 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.34 
 
 		 830 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.77 
 
 		 824 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  27.71 
 
 		 706 aa  85.5  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.87 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  39.2 
 
 		 377 aa  82.8  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 		 427 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.9 
 
 		 1537 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  32.81 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  24.53 
 
 		 666 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.41 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.2 
 
 		 587 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25.71 
 
 		 684 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.84 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  25.06 
 
 		 651 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  26.69 
 
 		 692 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.06 
 
 		 590 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  28.57 
 
 		 416 aa  62  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  32.35 
 
 		 232 aa  60.1  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.4 
 
 		 693 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25.67 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  32.82 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.52 
 
 		 680 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  34.15 
 
 		 403 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.16 
 
 		 682 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  26.64 
 
 		 659 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  31.06 
 
 		 207 aa  55.1  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.29 
 
 		 674 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  29.73 
 
 		 303 aa  53.9  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.06 
 
 		 680 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  23.71 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  23.1 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  36.56 
 
 		 176 aa  51.6  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  27.24 
 
 		 431 aa  50.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 691 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1758  hypothetical protein  43.48 
 
 		 445 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  30.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  35 
 
 		 152 aa  48.1  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  24.8 
 
 		 548 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  28.78 
 
 		 256 aa  47  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  30.09 
 
 		 1538 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.26 
 
 		 676 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>