62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1578 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  49.76 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  49.76 
 
 		 205 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  44.88 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  45.08 
 
 		 204 aa  171  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  45.36 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  44.9 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  36.36 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  36.36 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  36.08 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  34.34 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  38.8 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  36.11 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  37.91 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  38.46 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  37.91 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  34.97 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  38.67 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  35.84 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  38.67 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  38.46 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  38.46 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  38.46 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  37.57 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  37.71 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  36.36 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  36.11 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  36.31 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  36.31 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  34.04 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  37.21 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  36.9 
 
 		 247 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  40.5 
 
 		 138 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  33.15 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  37.67 
 
 		 442 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  27.18 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  48.1 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  28.8 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  44.44 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  32.74 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  31.29 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  32.56 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  42.37 
 
 		 171 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  29.63 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  30.95 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  30.67 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  26.46 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  29.92 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  47.17 
 
 		 89 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  47.37 
 
 		 78 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1450  tail fiber assembly protein, putative  27.1 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  42.11 
 
 		 88 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  30.43 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  42.11 
 
 		 89 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  46.15 
 
 		 82 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  40.51 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  36.76 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  29.26 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 140 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  28.29 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  50 
 
 		 175 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  38.6 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>