65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56930 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  96.92 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  72.97 
 
 		 226 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  72.97 
 
 		 226 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  72.97 
 
 		 226 aa  347  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  72.97 
 
 		 226 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  70.59 
 
 		 226 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  71.04 
 
 		 226 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  72.07 
 
 		 222 aa  331  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  67.57 
 
 		 226 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  68.02 
 
 		 229 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  52.97 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 305 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  28.38 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 282 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  34.68 
 
 		 272 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25.65 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  29.63 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 277 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 457 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  30.1 
 
 		 629 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.17 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  38.04 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  30 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 634 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2788  hypothetical protein  27.74 
 
 		 310 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00705384  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  34.58 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  30.19 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 178 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  36.78 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 246 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.43 
 
 		 255 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  27.53 
 
 		 246 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 224 aa  42  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  31 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 239 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  28.35 
 
 		 256 aa  42  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 382 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.55 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.09 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>