34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2788 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2788  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00705384  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2639  hypothetical protein  51.63 
 
 		 318 aa  324  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0609  methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.74 
 
 		 810 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 634 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5458  Methyltransferase type 12  32.8 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  31.98 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  28.02 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  28.8 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1525  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0931  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  25.95 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 249 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 1032 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.67 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.13 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  29.8 
 
 		 441 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 		 441 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  28.39 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  29.32 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1607  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 238 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  25.95 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0009  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  27.74 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>