73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26920 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  80.25 
 
 
317 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  61.51 
 
 
318 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  54.26 
 
 
327 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  52.37 
 
 
318 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  39.37 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  41.37 
 
 
326 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  40.13 
 
 
321 aa  188  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  34.29 
 
 
349 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  37.46 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  31.33 
 
 
338 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  34.57 
 
 
417 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  35.71 
 
 
329 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  36.93 
 
 
317 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  34.48 
 
 
329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  36.94 
 
 
361 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  37.13 
 
 
344 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  36.62 
 
 
361 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  31.08 
 
 
372 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  35.02 
 
 
334 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  36.31 
 
 
361 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  28.16 
 
 
323 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  36.16 
 
 
330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  28.88 
 
 
337 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  34.62 
 
 
354 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  38.65 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  33.66 
 
 
316 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  34.38 
 
 
365 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  34.59 
 
 
365 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  34.59 
 
 
365 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  34.38 
 
 
365 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  34.38 
 
 
365 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  36.21 
 
 
323 aa  136  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  35.05 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  34.63 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  34.89 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  35.35 
 
 
341 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  35.18 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  33.95 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  34.08 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
357 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
357 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  34.38 
 
 
346 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  33.11 
 
 
323 aa  125  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  33.84 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  34.36 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  34.28 
 
 
372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  31.55 
 
 
319 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  31.55 
 
 
319 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  25.07 
 
 
353 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  31.12 
 
 
344 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  33.65 
 
 
318 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  33.02 
 
 
341 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  25.07 
 
 
353 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  33.02 
 
 
341 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  32.85 
 
 
362 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  32.29 
 
 
339 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  31.75 
 
 
314 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  22.19 
 
 
316 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  24.71 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  23 
 
 
316 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  26.51 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  29.29 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  21.75 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  24.41 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  26.64 
 
 
275 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  25.95 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  25.8 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  26.45 
 
 
428 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  32.84 
 
 
263 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  40.23 
 
 
943 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  26.25 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  24.34 
 
 
384 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>