More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03480 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  93.45 
 
 		 476 aa  854    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 473 aa  937    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  60.68 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  54.73 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.17 
 
 		 485 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  52.17 
 
 		 509 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 574 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  53.39 
 
 		 490 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54 
 
 		 490 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  53.1 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  52.42 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  54.58 
 
 		 493 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  54.38 
 
 		 570 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  53.04 
 
 		 495 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  54.58 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 504 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  49.9 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 477 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 498 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  50.94 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.82 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.01 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 496 aa  323  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 490 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 477 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 501 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 509 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.95 
 
 		 502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  41.12 
 
 		 506 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 501 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 492 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 501 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 501 aa  282  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 509 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 492 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.19 
 
 		 501 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 516 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 516 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 488 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 496 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  42.51 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.98 
 
 		 472 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  36.98 
 
 		 520 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.85 
 
 		 503 aa  276  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.49 
 
 		 500 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 497 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 562 aa  274  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 502 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 502 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 502 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 491 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.94 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.26 
 
 		 471 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  40.88 
 
 		 492 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.81 
 
 		 497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.07 
 
 		 497 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 564 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 564 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 485 aa  270  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.9 
 
 		 494 aa  269  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.38 
 
 		 523 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.34 
 
 		 472 aa  269  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 		 569 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 506 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 506 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 520 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  39.48 
 
 		 520 aa  266  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>