More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15231 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_15231  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
392 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1085  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  61.64 
 
 
392 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1402  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  60.87 
 
 
392 aa  478  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484993  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  46.29 
 
 
392 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169143 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09801  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  42.46 
 
 
391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.37508 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  42.46 
 
 
391 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09821  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.03 
 
 
383 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.557826  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09611  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.11 
 
 
383 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.67 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.510844  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09591  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.11 
 
 
383 aa  268  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0886  histidyl-tRNA synthetase 2  36.05 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.151754  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  39.04 
 
 
420 aa  186  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0985  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.7 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0965259  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  36.39 
 
 
401 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1384  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.76 
 
 
407 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1354  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.76 
 
 
407 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0509  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.98 
 
 
408 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.57 
 
 
394 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  25.93 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.9 
 
 
392 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 
418 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 
431 aa  103  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.64 
 
 
389 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 
426 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  29.31 
 
 
389 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  24.75 
 
 
418 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 
418 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 
418 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  24.78 
 
 
418 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  26.01 
 
 
401 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 
430 aa  92.8  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  28.46 
 
 
449 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
425 aa  89.7  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  24.54 
 
 
421 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.43 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
417 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2097  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.07 
 
 
383 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0834258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  22.81 
 
 
380 aa  86.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  24.71 
 
 
377 aa  86.3  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  26.13 
 
 
421 aa  86.3  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4683  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  31.12 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.416531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0615  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  28.57 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.542186  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.27 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1502  Histidine--tRNA ligase  26.8 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1093  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.61 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.23 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2077  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.46 
 
 
383 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.85 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.03 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1940  tRNA synthetase class II (G H P and S)  27.66 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  28.41 
 
 
503 aa  82.8  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 
426 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  27.18 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.98 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.77 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  20.49 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.73 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  26.19 
 
 
525 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.98 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1888  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.23 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1563  tRNA synthetase class II (G H P and S)  30.23 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  21.17 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2599  Histidine--tRNA ligase  28.88 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  24.7 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  28 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.98 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  21.45 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  21.39 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  22.98 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0675  tRNA synthetase class II (G H P and S)  26.94 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2297  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  27.38 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.526463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  26.7 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  27.79 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1605  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.43 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344405  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.01 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000998206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2376  histidyl-tRNA synthetase  24.67 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2692  histidyl-tRNA synthetase 2  28.79 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  26.14 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  27.06 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2531  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.22 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020462  hitchhiker  0.00000966794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1264  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
410 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.41 
 
 
438 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  21.67 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>