More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02201 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
175 aa  350  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  81.71 
 
 
175 aa  294  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  77.14 
 
 
175 aa  280  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  76.57 
 
 
175 aa  278  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  77.01 
 
 
175 aa  276  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  73.14 
 
 
175 aa  273  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  73.14 
 
 
175 aa  272  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  73.14 
 
 
175 aa  272  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  73.14 
 
 
175 aa  271  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  72 
 
 
175 aa  266  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  64.67 
 
 
175 aa  225  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  58.08 
 
 
175 aa  209  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  56.55 
 
 
189 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  56.55 
 
 
189 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  59.65 
 
 
181 aa  207  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  56.73 
 
 
183 aa  202  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 
178 aa  197  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  48.35 
 
 
190 aa  186  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  40 
 
 
173 aa  111  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  42.77 
 
 
173 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  34.88 
 
 
176 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14715  predicted protein  36.84 
 
 
182 aa  104  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  35.17 
 
 
167 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
256 aa  101  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  34.34 
 
 
174 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  34.34 
 
 
174 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  36.81 
 
 
173 aa  99  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  35.22 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  32.1 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  36.77 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 
172 aa  90.9  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  37.97 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 
175 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  35.67 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  32.28 
 
 
166 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  32.53 
 
 
174 aa  89  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 
174 aa  87.8  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36113  Plastid ribosomal protein L10, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  36.47 
 
 
212 aa  87.4  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  30.72 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  30.49 
 
 
173 aa  87  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  30.46 
 
 
175 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  37.24 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  34.59 
 
 
202 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  32.88 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  32.5 
 
 
200 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  28.48 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  28.48 
 
 
166 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  31.48 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  31.48 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  36.55 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  33.93 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  32.93 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  36.11 
 
 
176 aa  84.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 
174 aa  84.3  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  32.35 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  33.96 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  34.19 
 
 
184 aa  84  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  29.3 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  30.72 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  33.53 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  32.72 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  36.3 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  35.97 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  31.13 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  29.82 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  33.56 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  33.33 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  29.31 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  32.62 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  29.11 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  33.78 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  31.87 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  32.08 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  32.92 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  32.1 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  32.74 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  36.3 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  32.43 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  29.94 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>