More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3623 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 431 aa  872    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  40.58 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  37.38 
 
 		 433 aa  272  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  29.86 
 
 		 446 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.09 
 
 		 738 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5261  glycoside hydrolase family 1  30.95 
 
 		 453 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.88 
 
 		 723 aa  143  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.64 
 
 		 730 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.84 
 
 		 730 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  32.91 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  28.68 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  28.02 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  26.3 
 
 		 440 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  26.56 
 
 		 440 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  26.95 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  28.07 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  26.82 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  29.71 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  24.04 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  23.39 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  24.53 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  23.13 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  27.88 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  26.98 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  21.9 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  28.12 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  27.12 
 
 		 460 aa  79.7  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  25.88 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  22.35 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  21.39 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  22.4 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  29.01 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  24.87 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  24.03 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  23.26 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  22.62 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  27.14 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  27.32 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  23.21 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  22.78 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  22.78 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  22.25 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  23.76 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  25.19 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  22.91 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  23.72 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  23.99 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  23.82 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  22.99 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  26.05 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  22.34 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  24.93 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  26.35 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  25 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  24.4 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  25.76 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  25.97 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  38.89 
 
 		 448 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  38.89 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  28.32 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  25.51 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  23 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  26.62 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 765 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  26.56 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  22.39 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  24.41 
 
 		 470 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  25.45 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  26.28 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  24.83 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  26.86 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  23.88 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  26.42 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  31.13 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  32.84 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  25.93 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  22.37 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  26.2 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  26.54 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 		 478 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  28.85 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  30.71 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  24.23 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  30.71 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  27.85 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  30.52 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl430  6-phospho-beta-glucosidase  20.36 
 
 		 480 aa  62  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  23.96 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 763 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  26.68 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  30.63 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  29.25 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  25.06 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  31.54 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  26.88 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  24.16 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>