More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3554 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3554  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
266 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.44 
 
 
270 aa  195  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.48 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.62 
 
 
262 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.4 
 
 
266 aa  182  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.63 
 
 
264 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.24 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.21 
 
 
265 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.73 
 
 
269 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.26 
 
 
278 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  46.39 
 
 
259 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.21 
 
 
263 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.21 
 
 
263 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.69 
 
 
263 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.92 
 
 
273 aa  175  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  43.44 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.79 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.95 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.38 
 
 
265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.67 
 
 
257 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.31 
 
 
278 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.93 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.85 
 
 
278 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.98 
 
 
278 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1566  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.2 
 
 
263 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.57 
 
 
288 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
294 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
268 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
268 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00648  Anthranilate synthase component 2 (EC 4.1.3.27)(Anthranilate synthase component II) [Includes Glutamine amidotransferase;Indole-3-glycerol phosphate synthase(IGPS)(EC 4.1.1.48);N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase(PRAI)(EC 5.3.1.24)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P06531]  39.77 
 
 
664 aa  168  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
265 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.06 
 
 
276 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
268 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 
270 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.53 
 
 
268 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.59 
 
 
266 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.3 
 
 
271 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.19 
 
 
263 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
267 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.51 
 
 
278 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.97 
 
 
295 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.51 
 
 
264 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.39 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  41.73 
 
 
267 aa  164  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.14 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.16 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.48 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.61 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.01 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.89 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.77 
 
 
270 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0835  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.98 
 
 
261 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303265  hitchhiker  0.00447803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.18 
 
 
272 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.19 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4050  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.23 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.04 
 
 
253 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.04 
 
 
253 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.449092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1319  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.04 
 
 
253 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000247169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1294  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.7 
 
 
253 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.78 
 
 
295 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.31 
 
 
258 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.04 
 
 
253 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.11 
 
 
264 aa  161  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1551  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.84 
 
 
255 aa  161  9e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
256 aa  161  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0940  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.35 
 
 
262 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1133  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.65 
 
 
253 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.07 
 
 
277 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1396  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.65 
 
 
253 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.02 
 
 
260 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.31 
 
 
260 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.78 
 
 
268 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.4 
 
 
267 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.76 
 
 
265 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.78 
 
 
272 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
271 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.27 
 
 
272 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.53 
 
 
268 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.45 
 
 
277 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
266 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.45 
 
 
277 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.53 
 
 
271 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.59 
 
 
259 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.72 
 
 
266 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3303  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.82 
 
 
244 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.693632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
262 aa  159  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.38 
 
 
270 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.75 
 
 
259 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3216  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.35 
 
 
260 aa  158  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.62 
 
 
279 aa  158  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.66 
 
 
266 aa  158  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1552  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.34 
 
 
264 aa  158  9e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.45 
 
 
295 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.01 
 
 
295 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 
266 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>