More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0841 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0841  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  635    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2432  hypothetical protein  55.1 
 
 		 287 aa  354  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0277  hypothetical protein  55.63 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3671  hypothetical protein  53.74 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000273453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1019  putative SAM-dependent methyltransferase  44.75 
 
 		 290 aa  282  6.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3845  hypothetical protein  42.47 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3027  putative SAM-dependent methyltransferase  41.69 
 
 		 298 aa  242  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129145 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0146  putative SAM dependent methyltransferase  40.66 
 
 		 381 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0151  SAM dependent methyltransferase, putative  40.33 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3463  SAM dependent methyltransferase  41.16 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0898386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0163  hypothetical protein  39.67 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3093  hypothetical protein  41 
 
 		 304 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0922  SAM-dependent methyltransferase  42.33 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.728224  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1373  putative SAM-dependent methyltransferase  38.51 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0024  hypothetical protein  40.86 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2221  SAM dependent methyltransferase  41.1 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0816781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3676  hypothetical protein  39.6 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1415  SAM-dependent methyltransferase-like protein  38.57 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418397  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0413  SAM dependent methyltransferase  41.98 
 
 		 405 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1219  oxidoreductase  40 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00837631  hitchhiker  0.00166496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0054  putative SAM-dependent methyltransferase protein  40.2 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0039  putative SAM-dependent methyltransferase protein  39.87 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2887  hypothetical protein  41.52 
 
 		 287 aa  202  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0743  oxidoreductase  37.62 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1397  SAM-dependent methyltransferase  42.23 
 
 		 252 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0684  hypothetical protein  32.87 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.654148  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  32.89 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  38.1 
 
 		 409 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.44 
 
 		 712 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.28 
 
 		 711 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.77 
 
 		 713 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.77 
 
 		 713 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.56 
 
 		 709 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.56 
 
 		 709 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.56 
 
 		 709 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.56 
 
 		 709 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  36.3 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.56 
 
 		 709 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.04 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.29 
 
 		 711 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.75 
 
 		 711 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  31.07 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.56 
 
 		 708 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.29 
 
 		 711 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.05 
 
 		 711 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.56 
 
 		 701 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1312  THUMP domain protein  25.98 
 
 		 768 aa  73.2  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.530559  normal  0.0438625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.82 
 
 		 711 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.88 
 
 		 715 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.24 
 
 		 699 aa  72.4  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  36.05 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.33 
 
 		 725 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  36.05 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1913  hypothetical protein  35.71 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  37.5 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  39.77 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  39.09 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  34.01 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  34.01 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  37.12 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  35.2 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.73 
 
 		 711 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26220  predicted SAM-dependent methyltransferase  26.82 
 
 		 657 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.4 
 
 		 713 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  32.28 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  32.28 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  31.13 
 
 		 560 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  31.37 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003438  23S rRNA (guanine-N-2-) -methyltransferase RlmL  27.05 
 
 		 706 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  29.68 
 
 		 839 aa  65.9  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  33.16 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  31.18 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  33.99 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  33.59 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  32.89 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  32.89 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  33.99 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.15 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  32.89 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.11 
 
 		 807 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  39.02 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  26.82 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  33.33 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.52 
 
 		 738 aa  63.5  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1191  oxidoreductase  29.63 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  33.33 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  31.14 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  28.48 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  31.25 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  32.68 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>