More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4485 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  100 
 
 		 295 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4378  inner-membrane translocator  48.12 
 
 		 294 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5342  inner-membrane translocator  47.7 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0863974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  45.15 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.34 
 
 		 298 aa  208  7e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 287 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2639  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2790  inner-membrane translocator  45.61 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.709673  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  36 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3726  inner-membrane translocator  44.11 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0694361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.31 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.17 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.45 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.17 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.25 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.25 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  38.51 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.81 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  34.43 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.95 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.82 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.95 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.95 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  38.56 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.82 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.82 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  37.82 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  40.13 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.82 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.95 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.94 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 305 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  38.76 
 
 		 311 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.78 
 
 		 316 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  36.91 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  37.62 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.63 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.95 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3900  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  38.83 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5396  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.378795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1747  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>