More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3908 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3908  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 423 aa  862    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5321  putative signal transduction histidine kinase  63.08 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0967984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5739  putative signal transduction histidine kinase  59.31 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4642  putative signal transduction histidine kinase  61.46 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  29.17 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  32.76 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3085  putative two component signal transduction protein  33.8 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  27.6 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 541 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  26.79 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 394 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 394 aa  93.6  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 552 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 725 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  28.7 
 
 		 632 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 748 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 541 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4182  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1317  sensory box sensor histidine kinase  24.19 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 553 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 535 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 650 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  31.58 
 
 		 830 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  26.94 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4665  histidine kinase  28.99 
 
 		 306 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  29.58 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  29.58 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  29.91 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  29.57 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 561 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1744  histidine kinase  27.22 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376505  normal  0.0197179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.75 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 548 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  29.38 
 
 		 475 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  30.3 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  28.94 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  31.51 
 
 		 596 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30.64 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  27.06 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  29.53 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30.21 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.25 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  29.92 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.3 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 1046 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4713  histidine kinase  28.94 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.739692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  25.09 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  27.11 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 662 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  28.46 
 
 		 619 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  29.33 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 484 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  29.96 
 
 		 683 aa  79.7  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 489 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 640 aa  79.7  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 489 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  28.46 
 
 		 680 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  24.74 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  29.49 
 
 		 662 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  25.09 
 
 		 372 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  24.74 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  31.38 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  25.09 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 545 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  27.34 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 1229 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  26.82 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  29.91 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  29.54 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  28.44 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>